生物有機肥集生物肥和有機肥優(yōu)點于一體，既有利于農產品增產增收，又可培肥土壤、改善土壤微生態(tài)系統(tǒng)、減少天機肥料用量，改善農產品品質。其作用主要有以下三個方面。

(一)提高作物產量，改善作物品質

    生物有機肥克服了化肥養(yǎng)分單一、供肥不平衡的缺點，注重生物、有機、無機相結合的養(yǎng)分互動互補作用，施用后既可提高作物產量，也可有效改善作物品質，提高農產品的安全性。生物有機肥營養(yǎng)物質釋放緩慢，以氮素營養(yǎng)而言，進入植物細胞后無需消耗大量能量和植物光合作用產物，如糖分和有機酸等，直接參與植物細胞物質的合成，故植物生長快，積累的糖分等物質多，自然農產品質量好，且很少有硝酸鹽等有害物質污染。

(二)提高土壤肥力，改善土壤理化性狀

    土壤有機質含量是土壤肥力的物質基礎，是衡量土壤肥力的一項重要指標。我國耕地土壤有機質含量偏低，平均僅為1．8％，與歐美等發(fā)達國家的地力水平差距較大。施用生物有機肥不僅能補充被消耗的有機肥料，而且還能不斷提高土壤有機質含羞。如在煙草的種植中應用生物有機肥，就可使土壤納有機質含量得到增加。此外，據(jù)研究，施用生物有機肥后，土壤容重較對照降低12．5％，毛管孔隙度增加9．8％，可以明顯改善土壤結構，提高土壤保水保肥和通氣能力。同時，速效磷、速效鉀、全氮、全磷和有機質含量分別比對照高出47．8％、77．1％、5．7％、65．o％和75．8％。相關研究還證明，有機質經微生物分解后，可縮合成新的腐殖質，它能與土壤中的黏土及鈣離子結合，形成有機一無機復合體。促進土壤中水穩(wěn)性團粒結構的形成，從而可以協(xié)調土壤中水、肥、氣、熱的矛盾，改善土壤結構，使土壤硫松、耕性交好。

（三）改善 土壤生態(tài)環(huán)境，減少植物病蟲害的發(fā)生

    生物有機肥具有改善土壤生態(tài)環(huán)境及改善土壤微生物區(qū)系的作用，在減少植物病蟲害發(fā)生方面發(fā)揮著更為重要的作用。這是因為在生物有機肥中含有多種特效菌，在微生物的生長繁殖過程中，能分泌出多種抗生素及植物生長激素，不但能抵制植物病源微生物的活動，起到防止植物病害的作用，而且能刺激作物的生長，使其根系發(fā)達，促進葉綠素、蛋白質和核酸的合成，提高植物的抗逆性。